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Caractérisation de gènes d’enveloppe de rétrovirus endogènes capturés au cours de l’évolution des mammifères et impliqués dans la placentation

proposé par Anne Dupressoir, CNRS, Villejuif

Projet de stage : Une partie considérable du génome des vertébrés est composée d’éléments répétés d’origine rétrovirale, les rétrovirus endogènes, intégrés au génome il y a plusieurs millions d’années lors d’infections de la lignée germinale. Notre laboratoire a identifié, dans plusieurs espèces -homme, souris, lapin et carnivores- des gènes d’enveloppe de ces rétrovirus endogènes, nommés syncytines, qui présentent une expression placentaire et peuvent faire fusionner les cellules entre elles. Des souris knockout générées dans le laboratoire ont démontré que les syncytines sont absolument nécessaires à la placentation et à la survie de l’embryon (Dupressoir et al, PNAS 2009, 2011). Il apparaît donc que la « capture » de rétrovirus endogènes a été un évènement majeur dans l’établissement et l’évolution de la structure placentaire (revue dans Dupressoir et Heidmann, Medecine/Science 2011). L’objectif du stage proposé est de rechercher la présence de syncytines dans d’autres branches de mammifères, afin de déterminer l’ampleur des évènements de « capture » rétrovirale au cours de l’évolution des mammifères. En pratique, à partir de gènes candidats qui auront été identifiés dans les banques de données, nous procèderons à leur clonage pour tester leur potentiel fusiogène en culture de cellules et nous analyserons leur profil d’expression pour établir la spécificité placentaire

Techniques mises en œuvre par le stagiaire : PCR, clonage, transfection dans des cellules en culture, reverse transcription, PCR quantitative en temps réel. Ces techniques sont classiquement utilisées dans le laboratoire.

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