Rôle de ‘heterochromatin protein 1’ (HP1) dans le maintien somatique de l’empreinte génomique

Projet de stage : L’empreinte génomique est un mécanisme épigénétique important contrôlé par des marques alléliques de méthylation de l’ADN. Des perturbations de cette empreinte sont associées à de nombreuses maladies chez l’Homme. Il est par conséquent essentiel d’identifier les protéines impliquées pour comprendre les mécanismes d’établissement et de maintenance de ces ‘empreintes’. Nous proposons donc d’étudier les protéines HP1 pour lesquelles nous avons des données préliminaires indiquant un lien avec l’empreinte. Il s’agira de caractériser les fonctions de ces HP1 dans la répression des gènes de l’empreinte et du développement. Nous avons pour cela développé des modèles de souris ‘knockout’, déficitaires dans le recrutement à la chromatine ou l’expression des HP1. Des cellules primaires obtenues de ces modèles seront utilisés pour diverses études épigénomiques ainsi que pour des explorations fonctionnelles. L’ensemble des travaux durant ce stage vise à explorer le rôle de HP1 dans l’empreinte génomique, une question essentielle vis-à-vis des maladies épigénétiques.

Techniques mises en œuvre par le stagiaire :

 Culture of primary cells (ES, MEF, other cell types)
 Chromatin immune-precipitation assays
 DNA methylation studies
 Gene expression studies
 Basic bio-informatic approaches
 Literature searches, documentation of experiments, oral and written presentation of data.